Bio-Rad_iCycleriQ荧光定量PCR仪是分子生物学实验室的常用设备,其精准的温度控制和灵敏的光学检测系统为基因表达分析、SNP分型等研究提供了可靠保障。要充分发挥这台仪器的性能,需要掌握一些关键的操作技巧。
在实验准备阶段,耗材的选择至关重要。推荐使用低吸附的PCR管或96孔板,并确保管盖闭合。反应体系的配制需要在冰上进行,各组分要充分混匀。引物和探针的浓度需要优化,通常引物终浓度为0.2-0.5μM,探针终浓度为0.1-0.2μM。模板DNA的加入量建议在1-100ng之间,过高可能导致扩增效率下降。
程序设置是实验成功的关键。退火温度需要根据引物的Tm值确定,通常比Tm低3-5℃。延伸时间根据扩增片段长度设置,一般按每分钟延伸1kb计算。建议设置熔解曲线分析步骤,以验证扩增特异性。对于多重PCR,需要仔细优化各通道的荧光采集温度,避免信号干扰。
数据分析时,要正确设置基线范围和阈值线。基线通常选择3-15个循环,阈值线设置在指数扩增期的线性范围内。对于相对定量,需要选择合适的内参基因,并使用ΔΔCt法计算目标基因的相对表达量。绝对定量则需要建立标准曲线,确保扩增效率在90%-110%之间。
仪器维护不容忽视。每月清洁样品槽和光学系统,使用无水乙醇擦拭样品槽,用镜头纸清洁光学元件。每季度校准温度控制系统,使用专用校准试剂盒验证各孔温度准确性。每年进行全面的光学系统校准,确保荧光检测的灵敏度和准确性。
掌握这些操作技巧,就能充分发挥Bio-Rad_iCycleriQ荧光定量PCR仪的性能,获得可靠的实验数据。随着使用经验的积累,实验人员还能根据具体研究需求,开发出更优化的实验方案。